2-Abz - 2-Aminobenzoil, obično se kombinuje sa 2,4-dinitrofenilom (Dnp) ili 3-nitro-tirozinom (NitroTyr) da formira parove Fluorophore/Quencher. ekscitacija na 320 nm, emisija na 420 nm.
3-Abz (m-aminobenzojeva kiselina) se može posmatrati kao -amino kiselina. Kada se m-aminobenzojeva kiselina ugradi u peptidne lance, to rezultira krutim zaokretom.
4-Abz (p-Aminobenzojeva kiselina, PABA), kao prirodni derivat benzojeve kiseline, može se koristiti i kao kruti linearni odstojnik.
Abu, L- -Aminobutiril ((S)-2-Amino-butanoil), -aminobutirna kiselina, je derivat aminokiseline. Zbog svoje strukturne sličnosti sa prirodnim aminokiselinama, često se koristi u dizajnu i sintezi peptida i peptidnih mimetika.
Ac predstavlja acetil. N-terminalna acetilacija je uobičajena stabilizacijska modifikacija za peptide u prirodi.
Acm, acetamidometil, može se ukloniti pomoću Hg(II) ili Ag(I). To je jedna od najčešće korištenih tiol zaštitnih grupa za cistein kada se sintetiziraju peptidi s višestrukim disulfidnim vezama.
ACTH (adrenokortikotropni hormon) je hormon koji luči prednja hipofiza i koji stimulira koru nadbubrežne žlijezde da proizvodi kortikosteroide.
Aad (L- -aminoadipinska kiselina) je neproteinogena aminokiselina. Njegova struktura je slična glutaminskoj kiselini (Glu), s dodatnom metilenskom grupom u bočnom lancu.
(2-Aminoetoksi)octena kiselina, poznata i kao glicin etil ester ili glicin etilamid, može se koristiti kao razmaknica ili linker u sintezi modifikacije peptida.
1-(1'-adamantil)-1-metil-etoksikarbonil, vrlo kiselo labilna amino zaštitna grupa u sintezi peptida, može se ukloniti sa 3% TFA/CH2Cl2
AFC (7-Amino-4-trifluorometilkumarin) je fluorescentno jedinjenje sa ekscitacijom oslobođenog kumarina na 395-400 nm, emisijom na 495-505 nm.
Vrste veće molekularne težine nastaju zbog nekovalentne adhezije manjih vrsta. Posebno kod proteina, agregacija je oblik denaturacije koja se može dogoditi na nepolarnim površinama sa sekundarnim strukturama, kao što su one koje tipično formiraju intramolekularne interakcije i koje su zakopane u -helikama i -listovima proteina. Molekule međusobno djeluju, ponekad tvoreći netopive polimolekularne oblike. Agregacija je u suprotnosti s oligomerizacijom, normalnom interakcijom pravilno presavijenih prirodnih proteina kako bi se formirali polimeri višeg reda.
AHX, aminoheksanoil,6-aminoheksanska kiselina, također skraćeno Aca ili LC, obično se uvodi kao kratki nepolarni razmak između biotina, fluorofora i peptidnih sekvenci.
2-Aminoizobuterna kiselina je rijetka neproteinska aminokiselina koja je krajnji produkt metabolizma pirimidina i izlučuje se urinom i prisutna je u nekim antibioticima gljivičnog porijekla. Također se koristi za zamjenu prirodnih aminokiselina za sintezu peptida.
Alkoholi su ona organska jedinjenja koja se odlikuju prisustvom jedne, dve ili više hidroksilnih grupa (-OH) koje su vezane za atom ugljenika u alkil grupi ili ugljovodoničnom lancu. Peptidni alkoholi su klinički ključna jedinjenja koja su nedovoljno istražena u studijama odnosa strukture i aktivnosti (SAR) za otkrivanje lekova. Na primjer, DAMGO je agonist opioidnih receptora modificiran alkoholom na C-terminalu, sa sekvencom Tyr-{d-Ala}-Gly-{Me-Phe}-Gly-ol. Ima visoku selektivnost i afinitet za μ-opioidni receptor.
Aldehid je organsko jedinjenje u kojem je karbonilna grupa vezana za atom ugljika na kraju ugljikovog lanca. Peptidni aldehidi su važna sredstva u biohemiji i hemijskoj biologiji za inhibiciju i hemijsko onemogućavanje proteaza.
Aloc - Aliloksikarbonil, amino zaštitna grupa (takođe skraćeno Alloc). Zaštita se može ukloniti sa Pd(PPh3)4.
Alchajmerova bolest, obilježena -amiloidnim plakovima i tau zapetljanjima, rezultat je sinaptičke disfunkcije i problema sa putevima čišćenja, što uzrokuje kognitivno oštećenje.
7-Amino-4-metilkumarin (AMC) je uobičajena fluorescentna sonda za obilježavanje peptida u studijama proteaze. Njegova konjugacija sa peptidom gasi fluorescentni signal, a oslobođeni AMC nakon cijepanja proteaze može kvantifikovati aktivnost enzima, sa ekscitacijskim/emisionim maksimumima od 345/445 nm. Na primjer, preferirani supstrat fluorescentni peptid za određivanje aktivnosti nalik tripsinu prečišćenog proteasoma, sa sekvencom: Ac-Arg-Leu-Arg-AMC.
Atrijalni natriuretski peptid (ANP), hormon koji proizvodi i oslobađa atrijum srca kao odgovor na povećan volumen krvi i pritisak. Funkcioniše tako da reguliše ravnotežu tečnosti i krvni pritisak potičući vazodilataciju, povećavajući proizvodnju urina (diurezu) i smanjujući reapsorpciju natrijuma u bubrezima. Ove akcije pomažu u suzbijanju efekata visokog krvnog pritiska i preopterećenja tečnošću u telu.
Antigeni peptidi su kratke aminokiselinske sekvence izvedene iz proteina ili drugih biomolekula koji pokreću imunološki odgovor organizma. Imuni sistem prepoznaje ove peptide kao strane ili strane organizmu, što dovodi do aktivacije imunih ćelija kao što su T ćelije i B ćelije. Antigeni peptidi igraju ključnu ulogu u imunološkim odgovorima, uključujući adaptivnu proizvodnju antitijela i razvoj imunološke memorije. Oni su široko proučavani u imunologiji i razvoju vakcina zbog njihovog potencijala da izazovu specifične imunološke odgovore protiv patogena ili abnormalnih ćelija.
Asimetrični razgranati peptid
Sinteza asimetričnih peptida sa 2, 4 i 8 grana može se postići strateškim umetanjem lizina, arginina ili glutaminske kiseline u sekvencu peptida.
Asimetrični dimetilarginin (ADMA)
Asimetrični dimetilarginin (ADMA, Arg(Me)2) je prirodno hemijsko jedinjenje i endogeni inhibitor sintaze azot oksida (NOS). Fmoc-Arg(Me)2-OH (asimetričan) se može direktno koristiti za sintezu peptida koji sadrže asimetrični dimetilarginin.
5-Aminovalerinska kiselina, može se koristiti kao razmaknica ili linker u sintezi modifikacije peptida.
Benzyloxymethyl (Bom) je kiselinski labilna imidazol zaštitna grupa koja se koristi u Boc-SPPS procesu za peptide koji sadrže histidin. Benziloksimetil proizvodi visoko reaktivni formaldehid nakon tretmana kiselinom. Zbog toga se Bom najbolje cepa u prisustvu Cys, metoksiamina ili drugih jedinjenja koja reaguju sa aldehidima.
-amino kiseline imaju svoju amino grupu vezanu za -ugljik, koji je drugi atom ugljika udaljen od karboksilne grupe. Opšta strukturna formula za -amino kiselinu može se predstaviti kao: R-CH(NH2)-COOH
Natriuretski peptid B-tipa (BNP), hormon koji proizvodi uglavnom srčane komore kao odgovor na pretjerano istezanje ćelija srčanog mišića. Ima ključnu ulogu u regulaciji krvnog pritiska i ravnoteže tečnosti, prvenstveno promicanjem vazodilatacije i povećanjem izlučivanja natrijuma kroz bubrege.
t-Butiloksikarbonil (Boc) je vrlo kiselo-labilea-amino zaštitna grupa u sintezi peptida, može se odcijepiti TFA/metilen hloridom (1:1), HCl u etil acetatu ili dioksanu, 98% mravlja kiselina.
2-(4-Bifenilil)izopropiloksikarbonil (Bpoc) je vrlo kiselo-labilea-amino zaštitna grupa u sintezi peptida, može se razdvojiti sa 1% TFA/metilen hlorida.
Peptidi sa 2, 4 i 8 grana mogu se postići strateškim umetanjem lizina, arginina ili glutaminske kiseline u sekvencu peptida.
t-Butildimetilsilil (TBS ili TBDMS) je hidroksilna zaštitna grupa kompatibilna sa Fmoc-SPPS. Otporan je na kiseline i može se selektivno cijepati jonima fluora.
Benzoil je acil grupa koja se često uvodi na N-kraj peptida. Manje je polaran od acetila (Ac) i može biti kao trajna modifikacija.
Benzil (Bzl) alkilni ostatak i zaštitna grupa bočnog lanca koji se koristi za blokiranje alkohola (Ser, Thr, Hyp) u sintezi peptida. može se cijepati jakim kiselinama ili katalitičkom hidrogenolizom (npr. vodonik/Pd).
Holecistokinin (CCK) je peptidni hormon koji proizvodi sluznica gornjeg crijeva i nalazi se u centralnom nervnom sistemu. Stimulira kontrakciju žučne kese, oslobađanje enzima pankreasa i utiče na različite gastrointestinalne procese.
Peptid vezan za kalcitonin (CGRP) je 37-aminokiselinski peptid srodan kalcitoninu, amilinu i adrenomedulinu. Postoji u dva oblika, -CGRP (CGRP I) i -CGRP (CGRP II), sa sličnim biološkim aktivnostima. CGRP se prvenstveno nalazi u senzornim i centralnim neuronima, utječući na kardiovaskularnu funkciju, metabolizam kalcija i fetoplacentarni vaskularni tonus. Njegovi receptori su vezani za G-protein i aktiviraju adenilat ciklazu, u interakciji sa proteinima koji modificiraju aktivnost receptora (RAMPs) za specifičnost liganda i ćelijski promet.
L-cikloheksilalanin (Cha) je nepolarni aminokiselinski analog fenilalanina, gdje je aromatični prsten zamijenjen cikloheksanskim prstenom. Ova zamjena omogućava proučavanje uloge aromatičnih amino kiselina u interakcijama kao što su π-π interakcije zamjenom ostataka fenilalanina sa Cha u eksperimentima.
L- -Cikloheksilglicin (Chg) je nepolarna aminokiselina koja je sterički otežana. Služi kao značajan farmaceutski međuprodukt, a nalazi se i u prirodnim proizvodima.
Holesterol se prirodno proizvodi u jetri i drugim stanicama u tijelu, ali može doći i iz hrane koju jedemo, posebno iz životinjskih proizvoda kao što su meso, perad i punomasni mliječni proizvodi. Kolesterol se može povezati s peptidima kako bi se poboljšala farmakokinetika.
cis-hidroksiprolin, stereoizomer prirodnog trans-hidroksiprolina.
Citrulin je prisutan u proteinima kao rezultat posttranslacijske enzimske modifikacije ostataka arginina.
CMK je inhibitor RSK2 kinaze sa sličnom snagom, ali manjom hemijskom stabilnošću od FMK.
Natriuretski peptid C-tipa (CNP) je peptid vaskularnih endotelnih ćelija, poznat po svojim vazodilatatornim efektima. Pokazuje strukturne i fiziološke sličnosti sa atrijalnim i moždanim natriuretičkim peptidima (ANP i BNP).
L- -Ciklopentilglicil (Cpg), je nepolarna aminokiselina koja je sterički otežana.
U peptidnoj sekvenci, taj jedinstveni ostatak koji je povezan sa linearnom sekvencom svojom amino grupom, ostavljajući je sa slobodnom karboksi grupom. Karboksilna grupa ovog ostatka može biti podvrgnuta modifikacijama kao što je amidacija ili, u slučajevima kao što je piroglutamat, unutrašnja laktamizacija.
Cijanin 3 je crveno-fluorescentna cijaninska boja koju obično pobuđuje izvor svjetlosti oko 558 nm i emituje svjetlost na približno 572 nm.
Cijanin 5 je fluorofor cijaninske boje koji emituje blisku infracrvenu fluorescenciju koju obično pobuđuje izvor svjetlosti oko 646 nm i emituje svjetlost na približno 664 nm.
L-, -Diaminobutirna kiselina je ,ω-diamino kiselina, kraći analog ornitina (Orn) i lizina (Lys). Uz odgovarajuću zaštitu, ,ω-diamino kiseline se mogu selektivno modificirati na svom Nω položaju ili inkorporirati kako bi se stvorili razgranati peptidi ili dendrimeri.
3-(Dimetilaminoazo)benzen-4-karboksilna kiselina, je hromofor povezan sa amino grupama koji se koristi u biohemiji i molekularnoj biologiji kao gasitelj u fluorescentnom rezonantnom prijenosu energije (FRET), npr. sa EDANS-om. Ekscitacija DABCYL-a na 454 nm.
Dabsyl ,4-dimetilaminobenzensulfonil hlorid, hromofor vezan za amino grupe koji se koristi kao gasitelj u kombinaciji, npr. sa EDANS-om. Ekscitacija Dabsyl-a na 436 nm.
4-Dimetilamino-1-naftalen-sulfonil, fluorofor vezan za amino grupe, ekscitacija na 342 nm, emisija na 562 nm.
L-, -Diaminopropionska kiselina (Dap ili Dpr) je ,ω-diamino kiselina, koja je kraći analog diaminobuterne kiseline (Dab), ornitina (Orn) i lizina (Lys). Modifikovani derivati ,ω-diaminokiselina mogu se selektivno menjati na svom Nω položaju ili ugraditi da bi se stvorili razgranati peptidi ili dendrimeri.
1-(4,4-Dimetil-2,6-dioksocikloheks-1-iliden)etil (Dde) je amino-zaštitna grupa koja se koristi u sintezi peptida. Može se selektivno cijepati korištenjem 2% hidrazin hidrata u dimetilformamidu (DMF). Nω-Dde omogućava specifično uklanjanje Dde iz aminokiselina kao što su Dap, Dab, Orn ili Lys nakon Fmoc sinteze peptida u čvrstoj fazi (SPPS), olakšavajući modifikaciju Nω-amino grupe na smoli.
Disulfidne veze su kovalentne veze formirane između dvije sulfhidrilne (-SH) grupe cisteinskih ostataka u proteinima.
2,4-dimetoksibenzil je zaštitna grupa formamida labilna na kiselinu koja se koristi za reverzibilnu modifikaciju kičme u sintezi peptida. Ugrađuju se tokom sinteze peptida u čvrstoj fazi (SPPS) kao aminokiselina ili dipeptid Fmoc-Dmb (Fmoc-Xaa-DmbYaa-OH), gdje Fmoc sprječava agregaciju peptida i na taj način promovira efikasno elongaciju. Dmb također potiče reakcije ciklizacije i sprječava stvaranje asparagimida. Za razliku od derivata Hmb, Dmb ne stvara benzoksazepine tokom aktivacije.
2,4-Dinitrofenil je hromofor koji je konjugiran sa amino grupama, koji se obično koristi kao gasitelj u supstratima za prijenos energije fluorescencije rezonance (FRET).
4,4′-Dimetoksiditil, također poznat kao bis-(4-metoksifenil)metil, je kiselinski labilna karboksamidna zaštitna grupa koja je kompatibilna sa Fmoc sintezom peptida u čvrstoj fazi (SPPS).
DOPA, 3,4-dihidroksifenilalanin, je prekursor nekoliko ključnih neurotransmitera, uključujući dopamin, norepinefrin i epinefrin.
(4,7,10-trikarboksimetil-1,4,7,10-tetraazaciklododecil)-sirćetna kiselina, skraćeno DOTA, je ciklični kelator koji je tipično vezan za N-terminus peptida. DOTA olakšava označavanje peptida radionuklidima kao što su 68Ga ili 90Y za različite biomedicinske primjene, uključujući snimanje i ciljanu terapiju.
Difenilmetil (ditil), kiselinski labilna N-, O- i S-zaštitna grupa.
Dietilentriaminpentaoctena kiselina (DTPA) je koristan helirajući agens za radionuklide kao što su (68)Ga, (99m)Tc i (111)In, koji su primjenjivi u nuklearnoj medicini.
5-[(2-Aminoetil)amino]naftalen-1-sulfonska kiselina (EDANS) je fluorofor koji se obično povezuje sa Nω diamino kiselina kao što je lizin. Često se koristi u FRET podlogama, obično uparen sa gasiteljima kao što je DABCYL. EDANS ima talasnu dužinu pobude od 340 nm i emituje na 490 nm.
Endotelni polipeptid koji aktivira monocite.
Etil, alkil grupa i homolog metila (Me), koristi se za trajne modifikacije N- i S-etilacije u peptidima.
Mapiranje epitopa (mapiranje epitopa antigena) je tehnika koja se koristi za određivanje specifičnih područja (tj. epitopa antigena) na antigenu koje antitela ili imuni sistem mogu prepoznati. Epitopi antigena mogu se podijeliti na linearne epitope i konformacijske epitope. Putem mapiranja epitopa antigena možemo duboko razumjeti odnos između strukture i funkcije antigena, što je od velikog značaja u razvoju vakcine, dijagnostici bolesti, imunoterapiji i drugim aspektima.
Neke najčešće korištene metode mapiranja epitopa antigena uključuju:
Rentgenska kristalografija: Može direktno analizirati trodimenzionalnu strukturu antigena, određujući tako položaj epitopa.
Nuklearna magnetna rezonanca: Može se koristiti i za analizu strukture antigena za određivanje epitopa.
Tehnika skeniranja peptida: Korištenje niza preklapajućih segmenata sintetičkih peptida za identifikaciju epitopa koji se vezuje za antitijelo.
Na primjer, u istraživanju i razvoju vakcina, razjašnjavanje ključnih epitopa na antigenu pomaže u dizajniranju efikasnijih vakcina i izazivanju ciljanijeg imunološkog odgovora; u dijagnostici bolesti, određivanje epitopa antigena povezanih sa specifičnim bolestima može razviti preciznije dijagnostičke reagense.
5-FAM (5-Carboxyfluorescein) je fluorofor koji se obično koristi za obilježavanje biomolekula, sa talasnom dužinom ekscitacije od 490 nm i emisijom na 520 nm.
Fluorescein{0}}karbonil je fluorofor vezan za amino grupe, sa talasnom dužinom ekscitacije od 490 nm i emisijom na 520 nm.
Fluorescein izotiocijanat (FITC) je fluorofor koji reaguje sa amino grupama. Prilikom označavanja peptida na njegovom N-kraju sa FITC-om, obično se ubacuje razmaknica poput -alanina ili Ahx. FITC ima talasnu dužinu ekscitacije od 490 nm i emisiju na 520 nm.
9-Fluorenilmetil je bazno labilna zaštitna grupa koja se koristi za O- i S-zaštitu.
FMK, fluorometil keton, je ireverzibilni inhibitor RSK2 kinaze.
9-Fluorenilmetoksikarbonil (Fmoc), amino zaštitna grupa u FMOC sintezi u čvrstoj fazi, može se ukloniti sa 20% piperidina/DMF.
Formil je indol zaštitna grupa koja se koristi u Boc-SPPS. Trp(For) se cijepa HF u prisustvu merkaptana ili bazama kao što je piperidin.
Prenos energije fluorescentne rezonancije (FRET) je prijenos neradijativne energije od pobuđenog fluorofora (donora) do odgovarajućeg akceptora (gasitelja). Prijenos ovisi o udaljenosti, orijentaciji dipola i spektralnom preklapanju donora i akceptora. U FRET supstratima, fluorofor i gasitelj su povezani preko peptidnog lanca. Enzimsko cijepanje povećava fluorescenciju razdvajanjem donora i akceptora.
Fluorescencija je svjetlost koju emituje supstanca koja apsorbira svjetlost ili drugo elektromagnetno zračenje. To se događa kada molekule zvane fluorofori apsorbiraju fotone određene valne dužine, postanu uzbuđeni, a zatim emituju fotone i vrate se u osnovno stanje. Emitovana svjetlost obično ima veću valnu dužinu i nižu energiju od apsorbirane svjetlosti, što rezultira karakterističnim spektrom fluorescencije. Ovaj fenomen se široko koristi u razne naučne i medicinske svrhe, uključujući mikroskopiju, protočnu citometriju i fluorescentnu spektroskopiju.
Gastrični inhibitorni polipeptid (GIP), također poznat kao insulinotropni peptid ovisan o glukozi, pripada porodici hormona sekretina. Stimulira lučenje inzulina, inhibira lučenje želučane kiseline i igra ključnu ulogu u regulaciji lučenja inzulina i homeostaze glukoze.
L- -Karboksiglutaminska kiselina (Gla) nastaje posttranslacijskom karboksilacijom glutaminske kiseline, što rezultira proteinima sposobnim da vežu jone kalcija, kao što je osteokalcin. Peptidi koji sadrže Gla idealno se sintetiziraju korištenjem Fmoc sinteze peptida u čvrstoj fazi (SPPS), jer Gla može podvrgnuti dekarboksilaciji kako bi se dobila glutaminska kiselina u prisustvu jakih kiselina.
Peptidi slični glukagonu su članovi superfamilije glukagona peptidnih hormona koji potiču iz C-terminalnog regiona proglukagona. Primarno ih sintetiziraju crijevne L ćelije.
Gonadotropin-oslobađajući hormon (LHRH) je dekapeptidni hormon koji se proizvodi u neurosekretornim ćelijama hipotalamusa i oslobađa u pulsirajućim naletima u cirkulaciju portala hipofize. Pulsirajuća sekrecija je kritična za reproduktivne funkcije, seksualni razvoj i diferencijaciju.
Hormon koji oslobađa hormon rasta (GHRH), također poznat kao somatorelin, je peptidni hormon hipotalamusa koji stimulira hipofizu da oslobađa i sintetiše hormon rasta.
Hormon koji oslobađa hormon rasta (GHRH), također poznat kao somatorelin, je peptidni hormon hipotalamusa koji stimulira hipofizu da oslobađa i sintetiše hormon rasta.
Humani leukocitni antigen (HLA) odnosi se na grupu proteina koji se nalaze na površini ćelija koji igraju ključnu ulogu u prepoznavanju stranih supstanci od strane imunološkog sistema. Oni su kodirani genima glavnog kompleksa histokompatibilnosti (MHC) kod ljudi i neophodni su za prezentaciju antigena T ćelijama, omogućavajući imunološkom sistemu da razlikuje između vlastitih i ne-ja ćelija. HLA molekuli su veoma raznoliki i polimorfni, što značajno doprinosi individualnom imunološkom odgovoru i podložnosti autoimunim bolestima i odbacivanju transplantata.
2-hidroksi-4-metoksibenzil je zaštitna grupa formamida labilna na kiselinu koja se koristi za reverzibilnu modifikaciju kičme u sintezi peptida. Ugrađen je kao aminokiselina ili Fmoc-Hmb dipeptid (Fmoc-Xaa-HmbYaa-OH) tokom sinteze Fmoc peptida u čvrstoj fazi (SPPS), sprečavajući agregaciju i omogućavajući efikasno proširenje peptida. Hmb također pomaže u reakcijama ciklizacije i sprječava stvaranje asparagina.
L-homoarginin je homolog L-arginina, skraćeno Har, i može se naći u plazmi i urinu. Homoarginin je rezultat gvanidinacije lizina, koja se također može izvesti na peptidima i proteinima.
Homocitrulin je homolog L-citrulina, skraćeno Hci, i može se otkriti u ljudskom urinu.
L-homocistein je homolog cisteina, skraćeno Hcy, a proizvodi se demetilacijom metionina. Povišeni nivoi Hcy u krvi su faktor rizika za kardiovaskularne i neurodegenerativne bolesti. Za razliku od Cys derivata, Hcy derivati se ne racemiziraju tokom spajanja, niti -eliminiraju.
Homolozi L-leucina, skraćeno Hle.
Homofenilalanin, homolog fenilalanina, skraćeno Hph, komponenta je ACE i inhibitora renina. Fmoc-Homophe-OH je potencijalni protuupalni lijek.
L-homoprolin ili L-pikolna kiselina, skraćeno Pip ili Hpr. Homolog prolina Hpr je proizvod razgradnje L-lizina. Oba enantiomera mogu se otkriti u ljudskoj plazmi. Budući da ostaci prolina snažno utiču na konformaciju peptida, zamjena Pro sa Hpr (ili azetidin-2-karboksilnom kiselinom (Aze)) može modulirati njegovu sekundarnu strukturu.
L-transhidroksiprolin se proizvodi posttranslaciono oksidacijom prolina. Hyp je glavna komponenta kolagena i proteina dagnji.
Izoserin, izomer L-serina, je -amino kiselina.
ivDde, amino zaštitna grupa, može se ukloniti i odcijepiti pomoću 2% hidrazin hidrata u DMF-u. ivDde je stabilniji od Dde na česte višestruke tretmane piperidinom tokom Fmoc-SPPS. Nω-ivDde se može selektivno ukloniti iz Dap, Dab Orn ili Lys, omogućavajući postsintetičku modifikaciju Nω-amino grupe na smoli.
Hemocijanin ključaonice (KLH) je veliki metaloprotein sa više podjedinica koji nosi kiseonik koji se nalazi u hemolimfi divovskog hemocijanina limpeta ključaonice. Kao nosilac antigena, KLH obično povećava imunogenost i sposobnost fiksiranja antigena spajanjem ciljnih polipeptidnih sekvenci, značajno promovišući stvaranje efikasnih, specifičnih i funkcionalnih antitela.
Hormon koji oslobađa luteinizirajući hormon (LHRH ili GnRH) je dekapeptidni hormon koji sintetiziraju neurosekretorne ćelije unutar hipotalamusa i pulsirajuće se oslobađa u cirkulaciju portala hipofize. Pulsirajuća sekrecija je ključna za reproduktivnu funkciju, seksualni razvoj i diferencijaciju.
U dizajnu i sintezi peptida, istraživači mogu umetnuti linker između biotina ili fluorescentnog i peptida. Uobičajeni hidrofobni odstojnik je aminoheksanska kiselina (Ahx), a uobičajen hidrofilni razmaknik je poli(etilen) glikol (PEG).
Proces sušenja zamrzavanjem, kojim se uklanja tekućina iz materijala osjetljivih na toplinu. Materijal se zamrzava, stavlja pod visoki vakuum i čuva na niskim temperaturama. Pritisak koji stvara vakuum uzrokuje da led prelazi iz čvrstog u plinovito stanje bez prolaska kroz tekuće stanje. Peptidi se obično isporučuju kao liofilizirani prah.
Tečna hromatografija-masena spektrometrija je svestrana analitička tehnika koja integriše tečnu hromatografiju sa masenom spektrometrijom kako bi pružila detaljne informacije o sastavu i strukturi molekula unutar složenih uzoraka.
Višestruki antigeni peptidi. Višestruki antigenski peptid je jedan moćan način za proizvodnju anti-peptidnih antitijela visokog titra i sintetičkih peptidnih vakcina.
Masena spektrometrija uz pomoć laserske desorpcije/jonizacije (MALDI-MS) je analitička tehnika koja se koristi za mjerenje omjera mase i naelektrisanja jona. Posebno je koristan za analizu biomolekula kao što su peptidi, proteini i polimeri.
Masena spektrometrija (MS) je moćna analitička tehnika koja se koristi za mjerenje omjera mase i naboja (m/z) jona.
4-Metoksi- -naftilamid, skraćeno MNA, je fluorofor koji je obično vezan za supstrat karboksipeptidaze na C kraju. Cepani 4M NA pobuđuje na 335-350 nm i emituje na 410-440 nm
Metoksibenzensulfonil (Mbs) je gvanidil zaštitna grupa koja se koristi u sintezi peptida u čvrstoj fazi na bazi Boc (Boc-SPPS). Ova zaštitna grupa može se ukloniti cijepanjem fluorovodonikom (HF).
4-Metilbenzil (Mbzl) je sulfhidrilna zaštitna grupa koja se koristi u sintezi peptida u čvrstoj fazi na bazi Boc (Boc-SPPS). Mbzl je stabilniji od metoksibenzila (Mob) pod čestim tretmanima trifluorosirćetnom kiselinom (TFA) i može se ukloniti cijepanjem fluorovodonika (HF).
(7-Metoksikumarin-4-il)sirćetna kiselina (Mca) je fluorofor koji se može povezati sa amino grupom.
Mca se vezuje za dinitrofenil (Dnp) za supstrate fluorescentnog rezonantnog prenosa energije (FRET). Talasna dužina ekscitacije je 325 nm, a talasna dužina emisije je 392 nm.
Hormon koji koncentrira melanin (MCH) je ciklični neuropeptid koji je prvi izolovan iz riba i pacova. MCH je prvenstveno uključen u regulaciju pigmentacije kože kod kostnih riba i ponašanja u hranjenju sisara.
Metil, najjednostavniji alkil supstituent, uključen je u N-, O- i S-metilaciju, koje čine trajne modifikacije peptida.
3-Metoksisukcinil, koji odgovara deaminiranom Asp(OMe), je polarna blokirajuća grupa N-terminala koja se obično uključuje u supstrate karboksipeptidaze.
Metilacija je posttranslacijska modifikacija (PTM) peptida i proteina gdje se metilna grupa (-CH3) enzimski dodaje specifičnim aminokiselinskim ostacima, obično lizinu (Lys), argininu (Arg), histidinu (His) ili glutamatu ( Glu). Ova modifikacija može značajno uticati na funkciju proteina, stabilnost i interakcije sa drugim molekulima, igrajući tako ključnu ulogu u regulaciji različitih ćelijskih procesa uključujući ekspresiju gena, transdukciju signala i interakcije protein-protein.
Glavni kompleks histokompatibilnosti (MHC) je genetska regija koja sadrži gene koji kodiraju MHC molekule. Ovi molekuli igraju ključnu ulogu u imunološkom sistemu i autoimunosti. Kod ljudi je ovaj kompleks poznat i kao sistem humanog leukocitnog antigena (HLA).
Molekuli MHC klase I (MHC I) su proteini na površini ćelije koji predstavljaju peptide iz unutrašnjosti ćelije do citotoksičnih T ćelija. Ovo pomaže imunološkim stanicama da prepoznaju i unište inficirane ili abnormalne stanice, što je ključno za imunološku odbranu od patogena i raka.
Molekuli MHC klase II (MHC II) su proteini na površini ćelije koji T ćelijama pomagačima predstavljaju peptide izvedene iz stranih supstanci. Ova interakcija je neophodna za koordinaciju imunoloških odgovora i aktivaciju drugih imunoloških stanica protiv patogena.
Monometilirani arginin (MMA) je posttranslacijska modifikacija gdje se jedna metil grupa (-CH3) enzimski dodaje gvanidino dušiku argininskog ostatka unutar peptida ili proteina
3-merkaptopropilamin, može se koristiti kao peptidni ligand ili modifikator u različitim biohemijskim i biomedicinskim primjenama.
Miristoilacija je proces modifikacije lipida u kojem je miristoilna grupa, koja se sastoji od 14-ugljikom zasićene masne kiseline, kovalentno vezana za N-terminus peptida. Ova modifikacija služi za pričvršćivanje proteina na ćelijsku membranu, olakšavajući njegovu lokalizaciju i učešće u različitim ćelijskim procesima.
-(1-naftil)-L-alanin je derivat nepolarne amino kiseline sličan fenilalaninu, ali sa naftil grupom umjesto fenil grupe.
-(2-Naftil)alanin je nepolarni derivat amino kiseline sličan fenilalaninu, ali sa naftil grupom umjesto fenil grupe.
3-nitrobenz-2-oksa-1, 3-diazol (NBD) se obično uvodi konjugacijom reagensa NBD-Cl na peptid. NBD-obilježeni peptidi se široko biraju zbog njihove upotrebe u studijama koje se fokusiraju na membrane i ćelijsku biologiju.
N-etilamid se može smatrati dekarboksiliranim oblikom C-terminalnog alanina. U buserelinu agonistu LHRH, NHEt služi kao analog C-terminalnog glicinamida. Peptid N-etilamid je otporan na razgradnju karboksipeptidazama.
L-norleucin (Nle) je stabilan izoster L-metionina. Kada je biološka aktivnost peptida ugrožena zbog stvaranja sulfoksida, Nle se može zamijeniti za Met bez tipične promjene njegovog funkcionalnog ponašanja.
NOTA, 1,4,7-triazacyclononane-1,4,7-triacetatna kiselina, je bifunkcionalni kelator koji služi kao okvir za konstruiranje PET alata za snimanje. Također se koristi u dizajnu sonde i pojačavanju signala kroz multivalentne efekte i ima potencijalnu primjenu kao dijagnostički radiofarmaceutik galija.
N-Me se obično odnosi na N-metilaciju, hemijsku modifikaciju u kojoj je metil grupa (-CH3) vezana za atom dušika u molekuli, kao što je N-Me-Gly, N-Me-Ser, N-Me -Tyr, N-Me-Thr, N-Me-Asp, N-Me-Glu, N-Me-Ala, N-Me-Phe, N-Me-Leu, N-Me-Ile, N-Me-Val, N-Me-Met, N-Me-Nle, N-Me-Nva, itd.
NODAGA,1,4,7-triazaciklononan,1-glutarna kiselina-4,7-dijasirćetna kiselina, je izvanredan bifunkcionalni kelator za dizajn i razvoj organometalnih radiofarmaceutika, nudeći značajne potencijal za primjenu u dijagnostičkom oslikavanju i ciljanoj radioterapiji.
2-Nitrofeniltio (Nps) je S-zaštitna grupa koja se koristi u sintezi peptida u čvrstoj fazi na bazi Boc (Boc-SPPS). Može se cijepati pomoću tiola, posebno preko slobodne sulfhidrilne grupe cisteina (Cys), što dovodi do istovremenog stvaranja disulfidne veze.
Neuropeptid Y (NPY) je istaknuti neuropeptid u mozgu i dio porodice neuropeptida Y, koja uključuje polipeptid pankreasa (PP) i peptid YY (PYY).
2-Nitro-2-piridilsulfenil (Npys) je S-zaštitna grupa koja je kompatibilna sa sintezom peptida u čvrstoj fazi na bazi Boc (Boc-SPPS). Npys se može cijepati pomoću tiola, posebno preko slobodne sulfhidrilne grupe cisteina (Cys), što rezultira simultanim stvaranjem disulfidne veze.
Norvalin je nepolarna alifatična aminokiselina i homolog -aminomaslačne kiseline (Abu).
-Naftilamid je fluorofor koji se obično koristi u supstratima karboksipeptidaze, tipično vezan na C-terminusu peptida. Cijepani NA pobuđuje na 330 nm i emituje na 370 nm.
-Naftilamid je fluorofor koji se obično koristi u supstratima karboksipeptidaze, tipično vezan na C-terminusu peptida. Rascijepljena NA na 320-340 nm, emisija na 410-420 nm.
Alil ester je karboksilna zaštitna grupa koja je kompatibilna sa sintezom peptida u čvrstoj fazi na bazi Fmoc i Boc (SPPS). Slično Aloc-u, alil estri se mogu selektivno ukloniti tretmanom sa Pd(PPh3)4. U Fmoc-SPPS, Asp(OAll) je podložan stvaranju aspartimida kataliziranom bazom.
Benzil ester, karboksilna zaštitna grupa, može se ukloniti katalitičkom hidrogenacijom (npr. H2/Pd) ili jakim kiselinama.
OcHex je standardna karboksilna zaštitna grupa koja se koristi u sintezi peptida u čvrstoj fazi na bazi Boc (Boc-SPPS).
4-(N-[1(4,4-dimetil-2,6-dioksocikloheksiliden)-3-etilbutil]amino)benzil estar (ODmab) je karboksilna zaštita grupa koja se koristi u Fmoc-baziranoj sintezi peptida na čvrstoj fazi (Fmoc-SPPS). Može se odcijepiti i ukloniti zaštita korištenjem 2% hidrazin hidrata u DMF-u.
2,4-Dimetoksibenzil ester je karboksilna zaštitna grupa vrlo labilna na kiselinu koja se može ukloniti upotrebom 1% TFA u dihlorometanu.
Etil ester, Zbog strogih uslova potrebnih za uklanjanje etil estera, modifikovanje peptida etil esterima može poboljšati njihovu lipofilnost i stabilnost.
9-Fluorenilmetil ester je bazno labilna karboksilna zaštitna grupa koja se može ukloniti upotrebom piperidina u DMF-u.
Heksil estri, Zbog strogih uslova potrebnih za uklanjanje etil estera, modifikovanje peptida etil esterima može poboljšati njihovu lipofilnost i stabilnost.
L-Otahidroindol-2-karboksilna kiselina (Oic) je nepolarna ometena amino kiselina. Umetanje ove aminokiseline srodne prolinu u polipeptidnu sekvencu snažno utiče na konformaciju peptida.
Metil estri su polutrajne C-terminalne zaštitne grupe u tečno-faznoj sintezi i mogu se pretvoriti u peptidne hidrazide, prekursore reaktivnih peptidnih azida. Azidno spajanje ostaje najpopularnija metoda spajanja fragmenata u sintezi peptida u tečnoj fazi.
3-Metilpent-3-il ester (OMpe) je kiselinski labilna karboksilna zaštitna grupa koja se često koristi za zaštitu karboksilne grupe asparaginske kiseline (Asp) u sintezi peptida u čvrstoj fazi na bazi Fmoc (Fmoc-SPPS ).Ovaj sterički zahtjevniji analog terc-butil estera razvijen je posebno za smanjenje asparagimida kataliziranog bazom formiranje.
Orto-nitrofenil estri Boc- ili Z-amino kiselina su preaktivirani derivati koji se koriste u sintezi peptidnog rastvora.
Ornitin (Orn) se proizvodi iz arginina tokom ciklusa ureje i može se takođe posmatrati u peptidima kao proizvod razgradnje arginina. Formiranje orna acilacijom gvanidinskog dijela arginina je uobičajena nuspojava u sintezi peptida.
Hidroksisukcinimid ester (OSu, skraćeno NHS) je preaktivirani derivat amino kiseline koji se obično koristi u sintezi peptida, posebno u modifikaciji peptida. OSu estri su sigurni, nesterični, kompatibilni sa vodenim sistemima i laki za rukovanje.
Terc-butil ester, kiselinski labilna karboksilna zaštitna grupa za aminokiseline u sintezi peptida.
4-aminobenzojeva kiselina (para-aminobenzojeva kiselina), može se koristiti za sintezu povezivača konjugata antitijelo-lijek. Na primjer, Mal-PEG2-Val-Cit-PABA je linker konjugata lijeka (ADC) koji se može cijepiti.
PABC (para-aminobenzil karbamat) je hemijsko jedinjenje koje se koristi u sintezi konjugata antitijelo-lijek (ADC) kao povezivač. Olakšava vezivanje lijekova na antitijela na kontroliran način, omogućavajući ciljanu isporuku lijekova u terapijama raka i drugim biomedicinskim primjenama. Na primjer, Mc-Val-Cit-PABC-PNP je linker koji se može cijepiti katepsinom koji se koristi u konjugatima antitijelo-lijek (ADC).
Polipeptid koji aktivira adenilat ciklazu hipofize (PACAP) je visoko konzerviran neuropeptid koji je istaknuto izražen u mozgu sisara. Svoje biološke efekte ispoljava povećanjem intracelularnog cikličkog AMP interakcijom receptora.
Palmitoil, nepolarna acilna grupa uvedena na N-kraj ili stranu. Palmitoilacija je također uočena kao posttranslacijska modifikacija proteina.
Fenilacetamid metil smola je smola dizajnirana posebno za sintezu peptida u čvrstoj fazi na bazi Boc (Boc-SPPS). Peptidi sintetizirani na ovoj smoli mogu se osloboditi HF cijepanjem.
U konjugatima antitijelo-lijek (ADC), linker povezuje antitijelo sa citotoksičnim teretom. Izbor korisnog opterećenja je kritičan jer određuje efikasnost i specifičnost ADC-a u davanju terapije ciljnim tkivima kroz specifične mehanizme oslobađanja.
2,2,4,6,7-Pentametildihidrobenzofuran-5-sulfonil (Pbf) je poželjna gvanidino zaštitna grupa koja se koristi u sintezi peptida na čvrstoj fazi na bazi Fmoc (Fmoc-SPPS). Pokazuje nešto veću kiselinsku labilnost u odnosu na Pmc.
Penicilamin je analog L-cisteina karakteriziran supstitucijom metil grupe (-CH3) karboksilnom kiselinom (-COOH).
Samosastavljanje peptida je kada se peptidi prirodno slažu u uređene strukture bez vanjske intervencije. ovaj proces je vođen nekovalentnim interakcijama kao što su vodonične veze, hidrofobne interakcije, elektrostatičke sile i π-π slaganje. Samosastavljanje peptida može dovesti do stvaranja različitih nanostruktura uključujući vlakna, sfere, listove i gelove, koji imaju primjenu u nauci o materijalima, biotehnologiji i medicini.
Fenilacetil (Phenylac ili Phac) je acil grupa tipično povezana na N-kraju peptida, koju karakteriše niži polaritet u poređenju sa acetilom (Ac). On predstavlja trajnu modifikaciju peptida.
fenilglicin (Phg) je derivat aminokiseline gdje fenilna grupa zamjenjuje atom vodika u molekuli glicina
Peptid Histidin Isoleucine (PHI), svinjski peptid povezan sa VIP i sekretinom.
Peptid histidin metionin (PHM), ljudski peptid srodan VIP-u.
Izoelektrična tačka (pI) je definirana kao nivo pH na kojem protein/peptid ima neto naboj od nule (Smoluch et al., 2016).
2,2,5,7,8-Pentametilhroman-6-sulfonil (Pmc) je gvanidinil zaštitna grupa koja se obično koristi u sintezi peptida u čvrstoj fazi na bazi Fmoc (Fmoc-SPPS). Poznato je po tome što je nešto manje otporan na kiseline u odnosu na Pbf.
p-nitroanilin, hromofor, je tipično konjugiran na C-terminus supstrata karboksipeptidaze. Apsorpcija oslobođenog p-nitroanilina se obično mjeri na talasnim dužinama oko 405 ili 410 nm.
L-Propargilglicin (Pra) proizvode mikroorganizmi. Ova aminokiselina, koju karakteriše struktura trostruke veze, veoma je cenjena kao temeljna jedinica za sintezu peptida sposobnih da se uključe u reakcije "klik hemije", privlačeći značajnu pažnju u ovoj oblasti.
Paratiroidni hormon (PTH) je peptidni hormon koji oslobađaju paratireoidne žlijezde, ključan za održavanje homeostaze kalcija i fosfora u ekstracelularnoj tekućini.
Posttranslacijske modifikacije (PTM) proteina dodaju funkcionalne grupe ili proteine, režu regulatorne podjedinice ili razgrađuju cijele proteine. Ove promjene, poput fosforilacije, glikozilacije, metilacije, acetilacije, lipidacije, ubikvitinacije, nitrozilacije i proteolize, utiču na to kako ćelije rade normalno i tokom bolesti. Razumijevanje PTM-a je ključno za osnovna istraživanja i pronalaženje novih tretmana.
piroglutaminska kiselina, poznata i po skraćenicama kao što su Pgl, Glp, pGlu ili
fenilazobenzilmetoksikarbonil je hromoforna N-zaštitna grupa koja se koristi u sintezi peptida, koja se može cijepati katalitičkom hidrogenacijom ili jakom kiselinom. Pokazuje maksimalne talasne dužine apsorpcije na 229 nm, 320 nm i 441 nm.
Par za gašenje se sastoji od fluorescentnog molekula (fluorofora) i molekula gasitelja koji se koristi u istraživanjima i testovima zasnovanim na fluorescenciji. Gasilac apsorbuje svetlost koju emituje fluorofor, smanjujući njegovu fluorescenciju. Kada su fluorofor i gasitelj razdvojeni, kao što je biohemijska reakcija, signal fluorescencije se povećava. Ovo omogućava istraživačima da mjere promjene i interakcije u realnom vremenu. Ova tehnika se obično koristi u aplikacijama kao što su PCR u realnom vremenu, molekularne sonde i FRET (Förster Resonance Energy Transfer) testovi.
Fluor-18 je radioligand koji se obično koristi u PET snimanju za procjenu metabolizma glukoze u tkivima i obično se koristi u dijagnozi raka i snimanju mozga.
Nasumična biblioteka peptida
Biblioteka nasumičnih peptida je zbirka mnogih kratkih peptidnih sekvenci generiranih nasumično. Svaki peptid u biblioteci ima specifičan broj aminokiselina sa nasumično određenim sekvencama, stvarajući raznolik raspon peptidnih molekula. Istraživači koriste ove biblioteke za skrining na peptide sa specifičnim svojstvima, biološkim aktivnostima ili interakcijama sa ciljnim molekulima. Posebno su korisni u otkrivanju lijekova, imunologiji i proučavanju interakcija proteina i proteina, pomažući u identifikaciji novih terapeutika i razumijevanju složenih bioloških procesa.
Ostatak je pojedinačna aminokiselina unutar peptida ili proteina. Kako se aminokiseline spajaju putem peptidnih veza kako bi formirale ove lance, svaka aminokiselinska jedinica naziva se ostatak. Ovaj izraz se koristi jer tokom formiranja peptidne veze, svaka aminokiselina gubi molekul vode (H2O), ostavljajući iza sebe ono što se naziva ostatkom.
Smola je nerastvorljivi polimer koji se koristi u sintezi peptida u čvrstoj fazi (SPPS) kao čvrsti nosač za kontinuirano dodavanje aminokiselina. Zrnca smole daju stabilnu i inertnu površinu za koju su kovalentno vezane početne aminokiseline, omogućavajući da se peptidni lanac izgradi ostatak po ostatak.
Rodamin B je svijetlo ružičasta do crvena boja s talasnom dužinom ekscitacije obično oko 540-570 nm i rasponom emitirane svjetlosti od 560-580 nm. Obično je konjugiran sa peptidnom sekvencom preko N-terminalne amino grupe peptida
Reverzno-fazni tečni hromatograf visokih performansi.
Odnos strukture i aktivnosti (SAR) lijekovi se razvijaju proučavanjem odnosa između hemijske strukture lijeka i njegove biološke aktivnosti.
Sarkozin, najjednostavnija N-alkilirana aminokiselina.
Simetrični dimetilarginin(SDMA, Arg(Me)2), Fmoc-Arg(Me)2-OH (simetrični) se mogu direktno koristiti za sintezu peptida koji sadrže simetrični dimetilarginin.
Solid-phase peptide synthesis (SPPS) je metoda za hemijsku sintezu peptida, gdje se peptidi sastavljaju postupno na čvrstoj podlozi ili smoli uzastopnim dodavanjem zaštićenih aminokiselina. SPPS obuhvata dvije strategije: Fmoc-SPPS i Boc-SPPS, koje se razlikuju po izboru zaštitnih grupa za N-amino grupu (Fmoc ili Boc) i zaštitnih grupa bočnog lanca. Odabrana vrsta N-amino zaštitne grupe diktira strategiju zaštite bočnog lanca i uslove za konačno odvajanje peptida od smole.
Statin, skraćeno Sta, je neproteinska aminokiselina koja se često koristi u dizajnu peptidnih mimetika, posebno u sintezi inhibitora proteaze.
Tert-Butiltio (StBu) je S-zaštitna grupa koja se cijepa redukcijom fosfina i kompatibilna je sa Boc-SPPS.
Sukcinil je polarna modifikacija N-terminala koja odgovara deaminiranom aspartatu i tipično je ugrađena u supstrate karboksipeptidaze.
TAMRA, također skraćeno TMR, je fluorofor koji se može vezati za amino grupu. Često se koristi u kombinaciji sa FAM-om za FRET podloge. TAMRA ima talasnu dužinu ekscitacije od 485 nm i talasnu dužinu emisije od 535 nm.
Tert-butil je zaštitna grupa labilna na kiselinu koja se obično koristi za alkohole i fenole, a koja se može odcijepiti pomoću trifluorosirćetne kiseline (TFA).
Trietilamonijum fosfat je pufer koji se koristi u pokretnim fazama HPLC reverzne faze.
Trifluorosirćetna kiselina (TFA) je korištena za cijepanje peptida od smole u Fmoc-SPPS i za uklanjanje zaštitnih grupa izvedenih iz tBu.
Trifluorometansulfonska kiselina (TFMSA) je jača kiselina od TFA. TFMSA se može koristiti kao sigurnija alternativa visoko toksičnom HF za završni korak cijepanja u Boc-SPPS strategiji.
L-tert-leucin (Tle) je nepolarna aminokiselina sa sterički zahtjevnim bočnim lancima koja destabilizira -helike.
2,4,6-Trimethoxybenzyl je kiselo-labilna Asn i Gln amidna zaštitna grupa koja se koristi u Fmoc-SPPS.
Tosil se koristi kao zaštitna grupa za gvanidin i imidazol u Boc-SPPS, a može se ukloniti pomoću Na/NH3
Tritil (Trt) je kiselinsko-labilna zaštitna grupa koja se koristi za Asn, Cys, Gln i His ostatke u Fmoc-SPPS. Može se selektivno ukloniti upotrebom trifluorosirćetne kiseline (TFA).
Bijeli liofilizirani prah
Čisti peptidi obično postoje u stanju bijelog praha nakon sušenja zamrzavanjem.
Vasoaktivni intestinalni peptid (VIP) je 28-aminokiselinski peptid koji pripada superfamiliji peptida glukagon-grelin-sekretin.
9-Ksanhidril (Xan) je zaštitna grupa amida labilna na kiselinu koja se koristi za Asn i Gln ostatke u Boc-SPPS. Xan se može selektivno ukloniti upotrebom TFA.
Kada je peptid obilježen FAM fluoresceinom, liofilizirani prah obično pokazuje žuti izgled.
Z-benziloksikarbonil, skraćeno kao Z ili Cbz, koristi se kao amino zaštitna grupa u sintezi peptida. Može se ukloniti hidrogenolizom ili jakim kiselinama kao čista HF ili HBr/sirćetna kiselina.