Poređenje hemijskih svojstava između PNA i DNK
PNA (peptidna nukleinska kiselina) i DNK (deoksiribonukleinska kiselina) imaju značajne razlike u hemijskim svojstvima, koje se uglavnom ogledaju u njihovoj molekularnoj strukturi, sastavnim jedinicama, bazama i prostornoj strukturi.
Molekularna struktura i sastavne jedinice
Molekularni skelet DNK povezan je naizmjeničnim vezama deoksiriboze i fosfata preko fosfodiestarskih veza. Glavni lanac PNA se sastoji od ponovljenih N - (2-aminoetil) - glicinskih jedinica povezanih peptidnim vezama (amidne veze). To znači da glavni lanac PNA ne sadrži negativno nabijene fosfodiestarske grupe, što čini vezivanje između PNA i lanaca DNK jačim nego između lanaca DNK.
Osnovni sastav
Osnove DNK su adenin (A), timin (T), citozin (C) i gvanin (G). Nasuprot tome, baza PNA se spaja sa N glicinskog dijela na glavnom lancu kroz acetilnu strukturu. Iako se sekvence baza PNA mogu vezati za lance DNK, načini njihovog vezivanja i stabilnost su različiti. Baze bočnih lanaca PNA mogu formirati vodonične veze sa bazama glavne brazde dvostruke spirale dvolančane RNK ili DNK, čime se vežu za spoljašnjost dvolančane RNK ili DNK.
Prostorna struktura i funkcija
DNK obično postoji u strukturi dvostruke spirale, koja je ključna za održavanje stabilnosti i prijenosa genetskih informacija. PNA može formirati strukturu trostruke spirale, koja ima jedinstvene prednosti u određenim aplikacijama kao što su uređivanje gena i senzor nukleinske kiseline.
Kombinacija funkcija i aplikacija
Zbog odsustva negativno nabijenih fosfodiestarskih grupa u glavnom lancu PNA, može se specifično vezati za DNK i RNK pri niskim koncentracijama soli. Ova karakteristika čini PNA stabilnijom i specifičnijom kada se koristi kao sonda ili sistem za isporuku lijeka. Metabolička stabilnost i jak afinitet vezivanja PNA čine ga korisnim alatom za antigensku terapiju, koja može inhibirati spajanje ili translaciju ciljne mRNA.
Rezime
Sve u svemu, glavne razlike u hemijskim svojstvima između PNA i DNK leže u njihovoj molekularnoj strukturi, sastavnim jedinicama, bazama i prostornoj strukturi. Ove razlike daju PNA jedinstvene prednosti u određenim aplikacijama, posebno u poljima kao što su uređivanje gena i sensing nukleinskih kiselina.
